合成ゲノミクス研究チーム

グループディレクターの紹介

写真グループディレクター：松井　南（理学博士）

メッセージ

探求するサイエンスから創造するサイエンスへ　若い方の参加を歓迎します。

学歴

1981年3月
埼玉大学理学部生化学科卒業
1986年3月
京都大学大学院生物物理学専攻修了　理学博士

職歴

1986年4月－1989年3月
日本獣医畜産大学分子腫瘍学研究室助手
1989年4月－1990年3月
同講師
1990年4月－1992年1月
日本医科大学分子生物学研究部門講師
1992年1月－1994年1月
米国Yale大学生物学部　鄧興旺　研究室ポストドクトラルフェローとして留学
1994年1月－1995年3月
日本医科大学分子生物学研究部門講師
1995年4月－1999年9月
（特）理化学研究所国際フロンティア研究プログラム分子機構研究室副チームリーダー(リーダー：Richard E. Kendrick)
1999年10月－2005年3月
（独）理化学研究所ゲノム科学総合研究センター植物ゲノム機能研究グループ植物変異探索研究チーム・チームリーダー
2005年4月－2006年
（独）理化学研究所ゲノム科学総合研究センター機能ゲノム研究グループ植物変異探索研究チーム・チームリーダー
2006年4月－2013年3月
（独）理化学研究所植物科学研究センター機能ゲノム研究グループ・グループディレクター
2010年4月－2015年3月
（独）理化学研究所バイオマス工学研究プログラム合成ゲノミクス研究チーム・チームリーダー
2015年4月－現在
（独）理化学研究所環境資源科学研究センターバイオマス工学研究部門合成ゲノミクス研究グループ・グループディテクター

主要論文

    <Original Paper>
  1. SnRK1 Kinase and the NAC Transcription Factor SOG1 Are Components of a Novel Signaling Pathway Mediating the Low Energy Response Triggered by ATP Depletion.Hamasaki H., Kurihara Y., Kuromori T., Kusano H., Nagata N., Yamamoto YY.,Shimada H., Matsui M. Front Plant Sci. 10:503(2019)
  2. Improvement of Agrobacterium-mediated transformation for tannin-producing sorghum. Kuriyama T., Shimada S., Matsui M. Plant Biotechnology 36(1):43-48(2019)
  3. Transcripts from downstream alternative transcription start sites evade uORF-mediated inhibition of gene expression in Arabidopsis. Kurihara Y., Makita Y., Kawashima M., Fujita T., Iwasaki S., Matsui M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115(30) 7831-7836 (2018)
  4. Construction of Para rubber tree genome and multi-transcriptome database accelerates rubber researches. Makita Y., Kawashima M., Lau N-S., Othman A.S., Matsui M. BMC Genomics 19 (2018)
  5. Large-scale collection of full-length cDNA and transcriptome analysis in Hevea brasiliensis. Makita Y., Ng KK., Singham G.V., Kawashima M., Hirakawa H., Sato S., Othman A.S., Matsui M. DNA Res. 24(2) 159-167 (2017)
  6. Chemical-Induced Inhibition of Blue Light-Mediated Seedling Development Caused by Disruption of Upstream Signal Transduction Involving Cryptochromes in Arabidopsis thaliana. Ong WD., Okubo-Kurihara E., Kurihara Y., Shimada S., Makita Y., Kawashima M., Honda K., Kondoh Y., Watanabe N., Osada H., Cutler SR., Sudesh K., Matsui M. Plant Cell Phys. 58(1) 95-105 (2017)
  7. Photoactivation and inactivation of Arabidopsis cryptochrome 2
    Wang Q., Zuo Z., Wang X., Gu L., Yoshizumi T., Yang Z., Yang L., Liu Q., Liu W., Han Y-J., Kim J-L, Liu B., Wohlschlegel J. A., Matsui M., Oka Y., Lin C. SCIENCE 354 (6310) 343-347 (2016)
  8. Modification of plant cell wall structure accompanied by enhancement of saccharification efficiency using a chemical, lasalocid sodium. Okubo-Kurihara E., Ohtani M., Kurihara Y., Kakegawa K., Kobayashi M., Nagata N., Komatsu T., Kikuchi J., Cutler S., Demura T., Matsui M. Sci. Rep. 6 (2016)
  9. The rubber tree genome shows expansion of gene family associated with rubber biosynthesis. Lau NS., Makita Y., Kawashima M., Taylor TD., Kondo S., Othman AS., Shu-Chien AC., Matsui M. Sci. Rep. 6 (2016)
  10. MOROKOSHI: Transcriptome Database in Sorghum bicolor. Makita, Y., Shimada, S., Kawashima, M., Kuriyama-Kondou, T., Toyoda, T., Matsui, M. Plant Cell Physiol. 56: e6(1–8) (2015)
  11. Functional and expression analyses of transcripts based on full-length cDNAs of Sorghum bicolor. Shimada, S., Makita, Y., Kuriyama-Kondou, T., Kawashima, M, Mochizuki, Y., Hirakawa, H., Sato, S., Toyoda, T. Matsui, M. DNA Res. 22(6): 485–493 (2015)
  12. RNA-seq analysis provides insights for understanding photoautotrophic polyhydroxyalkanoate production in recombinant Synechocystis sp. Nyok-Sean, Lau, NS., Foong, CP., Kurihara, Y., Sudesh, K., Matsui, M. PLOSONE, doi; 10.1371/journal. pone.0086368 (2014)

And 38 more publications from April 2013-March2019.

    <Review Articles>
  1. Cyanobacteria: Photoautotrophic Microbial Factories for the Sustainable Synthesis of Industrial Products. Lau NS., Matsui M., Abdullah Amirul AA. Biomed researfch International (2015)

    <Invited Book Chapters>
  1. Phenotype-Based Screening of Small Molecules to Modify Plant Cell Walls Using BY-2 Cells. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) Okubo-Kurihara E., Matsui M. (2018)
  2. Photoautotrophic Polyhydroxyalkanoate Production in Cyanobacteria. Sam KK., Lau NS., Amirul Al-AA., Matsui M. from: Cyanobacteria: Omics and Manipulation (Edited by: Dmitry A. Los). Caister Academic Press, U.K. Pages: 235-252. (2017)
  3. Agrobacterium-Mediated Genetic Transformation for Larger Seed Size in Jatropha. The Jatropha Genome pp 191-203 Enoki H., Funato A., Nabetani Y., Takahashi S., Ichikawa T., Matsui M., Motohashi R. (2017)
  4. PHA from sunlight –New route for bioplastics production in cyanobacteria via photosynthesis. Matsui, M. Bioplastics Magazine 9, 20-21. (2014)
  5. High-throughput analysis of rice genes by means of the heterologous full-length cDNA overexpressor (FOX)-hunting system. Higuchi-Takeuchi, M, Mori, M, Matsui, M. Int J Dev Biol. 57, 517-523 (2013)
  6. Screening for gene function using the FOX (full-length cDNA overexpressor gene) hunting system. Higuchi-Takeuchi, M, Matsui, M. Methods Mol Biol. 1056, 201-210. (2013)